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Die D.O.Ca Rioja steht sowohl unter Atlantik- als auch unter Mittelmeereinfluss. Je nach Teilgebiet dominiert der eine oder andere Klimafaktor. In der Rioja Alta herrscht der Atlantik vor und sorgt eine Durchschnittstemperatur von 13 Grad Celsius und eine jährliche Niederschlagsmenge von 380 Litern pro Quadratmeter. Das Mittelmeer gibt in der Rioja Baja den Ton an, wo die Temperatur auf 14,4 Grad Celsius steigt und nur 280 Liter Regen und Jahr fallen. Am kühlsten und niederschlagreichsten ist das Klima der Rioja Alavesa, die zwar gleichzeitig von Atlantik und Mittelmeer beeinflusst wird, aber in Höhenlagen von fast 500 Metern liegt, was eine Durchschnittstemperatur von nur 12,7 Grad Celsius mit 520 Litern Niederschlag pro Jahr zur Folge hat.
Der Kontrollrat der D.O.Ca Rioja (auf Spanisch: Consejo Regulador) ist die Regulierungsinstanz der geschützten Ursprungsbezeichnung. Seine Aufgabe ist es, die Richtlinien für Anbau und Erzeugung der Rioja-Weine festzulegen und ihre Einhaltung zu überwachen, mittels technischer Analysen die Qualität der Weine von der Bodega bis zum Verbraucher sicherzustellen sowie ihre Vermarktung zu unterstützen. Außerdem bewertet er jeden Jahrgang je nach Qualität „gut“, „sehr gut“ oder „ausgezeichnet“. Der Kontrollrat setzt sich aus Weinbauern und -produzenten, Önologen, Juristen und Marketing-Profis zusammen und hat seinen Sitz in Logroño. Er untersteht dem Nationalen Institut für geschützte Ursprungsbezeichnungen (I.N.D.O.), das wiederum dem Landwirtschaftsministerium angegliedert ist. Amtierender Präsident des Consejo Regulador der D.O.Ca Rioja ist Víctor Pascual Artacho.